Protein–RNA interactions for Protein: Q924T3

Xrcc4, DNA repair protein XRCC4, mousemouse

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc4Q924T3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Xrcc4Q924T3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Xrcc4Q924T3 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Xrcc4Q924T3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Xrcc4Q924T3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Xrcc4Q924T3 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms