Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dkk4Q8VEJ3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms