Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Smg8Q8VE18 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Smg8Q8VE18 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Smg8Q8VE18 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smg8Q8VE18 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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