Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Fam20bQ8VCS3 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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