Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc12Q8R344 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc12Q8R344 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms