Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MyripQ8K3I4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MyripQ8K3I4 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms