Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Abcf3Q8K268 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Abcf3Q8K268 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Abcf3Q8K268 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Abcf3Q8K268 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Abcf3Q8K268 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abcf3Q8K268 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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