Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trip10Q8CJ53 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms