Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms