Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pramef8Q8CE24 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms