Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf428Q8C1M2 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms