Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Pdcl3Q8BVF2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdcl3Q8BVF2 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdcl3Q8BVF2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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