Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp43Q8BUM9 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp43Q8BUM9 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp43Q8BUM9 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms