Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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