Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q8BGC1 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Q8BGC1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8BGC1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8BGC1 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8BGC1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8BGC1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8BGC1 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q8BGC1 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q8BGC1 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms