Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smim19Q80ZU4 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.2 ms