Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Topbp1Q6ZQF0 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms