Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Zbtb40Q6PCS8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Zbtb40Q6PCS8 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Zbtb40Q6PCS8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Zbtb40Q6PCS8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Zbtb40Q6PCS8 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Zbtb40Q6PCS8 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Zbtb40Q6PCS8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Zbtb40Q6PCS8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbtb40Q6PCS8 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms