Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf2Q6P9P0 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms