Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rrp12Q6P5B0 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms