Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

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Length 993 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sycp1Q62209 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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