Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

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Length 706 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Mre11Q61216 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Mre11Q61216 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Mre11Q61216 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mre11Q61216 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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