Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Utp18Q5SSI6 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms