Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pfdn4Q3UWL8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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