Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Obox3Q3UT54 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Obox3Q3UT54 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms