Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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D13Ertd608eQ3UPR8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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D13Ertd608eQ3UPR8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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D13Ertd608eQ3UPR8 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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D13Ertd608eQ3UPR8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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D13Ertd608eQ3UPR8 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
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D13Ertd608eQ3UPR8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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D13Ertd608eQ3UPR8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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D13Ertd608eQ3UPR8 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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D13Ertd608eQ3UPR8 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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D13Ertd608eQ3UPR8 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
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D13Ertd608eQ3UPR8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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D13Ertd608eQ3UPR8 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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