Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skap2Q3UND0 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms