Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

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Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Usp19Q3UJD6 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Usp19Q3UJD6 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Usp19Q3UJD6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Usp19Q3UJD6 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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Usp19Q3UJD6 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms