Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Rnf224Q3UIW8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Rnf224Q3UIW8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Rnf224Q3UIW8 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Rnf224Q3UIW8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnf224Q3UIW8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
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