Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LbrQ3U9G9 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LbrQ3U9G9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LbrQ3U9G9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LbrQ3U9G9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LbrQ3U9G9 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LbrQ3U9G9 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LbrQ3U9G9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LbrQ3U9G9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LbrQ3U9G9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LbrQ3U9G9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LbrQ3U9G9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LbrQ3U9G9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LbrQ3U9G9 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LbrQ3U9G9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LbrQ3U9G9 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LbrQ3U9G9 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LbrQ3U9G9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LbrQ3U9G9 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LbrQ3U9G9 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LbrQ3U9G9 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LbrQ3U9G9 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LbrQ3U9G9 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LbrQ3U9G9 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LbrQ3U9G9 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LbrQ3U9G9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LbrQ3U9G9 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LbrQ3U9G9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LbrQ3U9G9 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LbrQ3U9G9 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LbrQ3U9G9 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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