Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Rnf40Q3U319 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rnf40Q3U319 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rnf40Q3U319 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rnf40Q3U319 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rnf40Q3U319 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rnf40Q3U319 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rnf40Q3U319 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rnf40Q3U319 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rnf40Q3U319 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rnf40Q3U319 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf40Q3U319 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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