Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc174Q3U155 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms