Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hddc2Q3SXD3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hddc2Q3SXD3 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms