Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccbe1Q3MI99 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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