Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

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Length 1,197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Zbtb38Q3LR78 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Zbtb38Q3LR78 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Zbtb38Q3LR78 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Zbtb38Q3LR78 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Zbtb38Q3LR78 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Zbtb38Q3LR78 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Zbtb38Q3LR78 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Zbtb38Q3LR78 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbtb38Q3LR78 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms