Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VgfQ0VGU4 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VgfQ0VGU4 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms