Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp2b3Q0VF55 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atp2b3Q0VF55 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atp2b3Q0VF55 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atp2b3Q0VF55 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atp2b3Q0VF55 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atp2b3Q0VF55 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atp2b3Q0VF55 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atp2b3Q0VF55 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp2b3Q0VF55 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp2b3Q0VF55 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp2b3Q0VF55 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp2b3Q0VF55 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp2b3Q0VF55 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp2b3Q0VF55 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp2b3Q0VF55 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp2b3Q0VF55 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp2b3Q0VF55 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp2b3Q0VF55 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms