Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms