Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
AmbpQ07456 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms