Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cdx4Q07424 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms