Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gdf3Q07104 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms