Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cacna1sQ02789 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms