Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Itga4Q00651 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms