Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shc1P98083 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shc1P98083 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shc1P98083 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Shc1P98083 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Shc1P98083 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms