Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptprn2P80560 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptprn2P80560 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptprn2P80560 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ptprn2P80560 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptprn2P80560 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ptprn2P80560 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptprn2P80560 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ptprn2P80560 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ptprn2P80560 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ptprn2P80560 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptprn2P80560 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptprn2P80560 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptprn2P80560 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ptprn2P80560 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ptprn2P80560 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ptprn2P80560 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptprn2P80560 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ptprn2P80560 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ptprn2P80560 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ptprn2P80560 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ptprn2P80560 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptprn2P80560 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptprn2P80560 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptprn2P80560 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Ptprn2P80560 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Ptprn2P80560 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptprn2P80560 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptprn2P80560 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptprn2P80560 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptprn2P80560 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptprn2P80560 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptprn2P80560 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptprn2P80560 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptprn2P80560 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptprn2P80560 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptprn2P80560 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptprn2P80560 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptprn2P80560 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptprn2P80560 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptprn2P80560 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptprn2P80560 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptprn2P80560 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptprn2P80560 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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