Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tp53bp1P70399 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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