Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad50P70388 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad50P70388 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad50P70388 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad50P70388 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad50P70388 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad50P70388 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad50P70388 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad50P70388 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad50P70388 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad50P70388 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms