Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga11P61622 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga11P61622 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga11P61622 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga11P61622 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga11P61622 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Itga11P61622 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms