Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Taf13P61216 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Taf13P61216 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Taf13P61216 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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Taf13P61216 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Taf13P61216 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Taf13P61216 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Taf13P61216 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Taf13P61216 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Taf13P61216 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Taf13P61216 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Taf13P61216 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Taf13P61216 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Taf13P61216 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Taf13P61216 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Taf13P61216 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Taf13P61216 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Taf13P61216 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Taf13P61216 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Taf13P61216 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Taf13P61216 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Taf13P61216 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Taf13P61216 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
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Taf13P61216 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Taf13P61216 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms