Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcbp1P60335 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms